Evästeet

Hei! Verkkopalvelussamme käytetään evästeitä ja muita vastaavia työkaluja. Lisäksi seuraamme kävijäliikennettä anonyymisti. Voit sallia välttämättömät evästeet, tietyt evästeet tai kaikki evästeet. Lue lisää tietosuojaselosteestamme

Siirry sisältöön
Manual extraction gathered information on the drug treatment for ulcerative colitis

Etusivu > Kaikki artikkelit > Manuaalinen tietojen poiminta keräsi tietoa haavaisen paksusuolentulehduksen lääkehoidosta

Manuaalinen tietojen poiminta keräsi tietoa haavaisen paksusuolentulehduksen lääkehoidosta

Sairaaloiden tietoaltaat ovat keskeinen tietolähde Medaffconin tutkimuksissa, ja usein tietojen haku voidaan automatisoida. Mitä tapahtuu, kun tietokannoista poimitaan monimutkaisempia tietoja? Tällöin käytetään manuaalista tietojen poimintaa, kertoo Medaffconin tieteellinen asiantuntija Riikka Mattila.

Manuaalinen tietojen poiminta mahdollistaa monimutkaisen tiedonkeruun

Kun tietojen hakua ei voida automatisoida erilaisten lähteiden vuoksi, manuaalinen tietojen poiminta on ratkaisu.

Hyvä esimerkki manuaalisesta poiminnasta on viime syksynä julkaistu Real-World Evidence (RWE) -tutkimus, jossa tutkittiin haavaisen paksusuolentulehduksen hoidon vaikuttavuutta. Tutkimukseen osallistui 23 suomalaista haavaisen paksusuolentulehduksen hoitoon erikoistunutta IBD-keskusta.

Mattilan mukaan kaikki tiedonhaku tehtiin manuaalisesti. Jokaisessa sairaalassa kliininen asiantuntija poimi tiedot potilasasiakirjoista käsin ja kirjasi ne erilliselle tutkimuslomakkeelle. Tutkimuksessa etsittiin oireita ja sairauden vaikeusastetta kuvaavia muuttujia.

”Suomessa on neljä tietoallasta: Helsingissä, Tampereella, Kuopiossa ja Turussa. Jos tietoja tarvitaan muista sairaaloista, tietokantoja ei ole saatavilla, vaan tiedot on haettava manuaalisesti. Näin kävi tässäkin tutkimuksessa”, Mattila kertoo.

Mattilan mukaan tietoaltaat mahdollistavat lukuisten tietojen automaattisen louhinnan ja matemaattisen analyysin erityisesti silloin, kun on kyse suoraviivaisista muuttujista, kuten hemoglobiinista.

”Kun kerätään esimerkiksi monimutkaisia oireita, niitä ei voida automaattisesti poimia tietoaltaasta. Voi olla esimerkiksi diagnoosi, johon lääkäri on sisällyttänyt oireita. Tällöin ihmisen on haettava tiedot”, Mattila sanoo.

Hän kertoo, että Suomessa tämäntyyppinen rekisteritutkimus on teknisesti samanlainen kuin muutkin rekisteritutkimukset, vaikka tiedot haetaan potilastiedoista. Koska kyseessä on rekisteritutkimus eikä kliininen tutkimus, se ei vaadi eettisen toimikunnan hyväksyntää. Hyväksymisprosessi on siten kevyempi.

”Muissa maissa tietojen hakeminen suoraan potilasasiakirjoista voi olla haastavaa. Suomessa tällainen tutkimus vaatii vain Findatan tai rekisterinpitäjän luvan. Tämä kuuluu terveys- ja sosiaalitietojen toissijaisesta käytöstä annetun lain piiriin”,
Mattila huomauttaa.

Työskentely tutkimuksen parissa Medaffconissa

Medaffcon teki tutkimusta tofacitinibin tehokkuudesta haavaisen paksusuolentulehduksen hoidossa yhteistyössä Pfizerin ja suomalaisten gastroenterologien kanssa. Mattila muodosti yhdessä biostatistikko Iiro Toppilan ja datatieteilijä Olivia Hölsän kanssa Medaffconin tiimin. He kuuluvat Data- ja RWE-tiimein, joissa on yhteensä 15 asiantuntijaa.

Mattila liittyi Medaffconiin kolme vuotta sitten. Tehtävässään hän tekee pääasiassa RWE-tutkimuksia. Hänellä on laaja kokemus eri terapia-alueilta, ja hänellä on noin 15 vuoden tutkimuskokemus, josta kolme vuotta Max Planck -instituutissa Saksassa.

”Nykyisessä tehtävässäni on mielenkiintoista se, että saan tehdä tiedettä. Ja Medaffconissa on hyvä ilmapiiri”, Mattila kertoo.

Takaisin ylös